Claude, Skorpion Nörotoksinlerine Karşı Protein Bağlayıcıları Tasarladı

Anthropic, Claude'un ilaç keşfi süreçlerini hızlandırma potansiyelini test etmek amacıyla, skorpion nörotoksinlerine karşı minibinder tasarlama projesi yürüttü. İç araştırma modeli, dört takip sorusu eşliğinde, 64 saat içinde 12 tasarım aracını kullanarak 318.484 tasarım üretti ve bunlardan 180'ini laboratuvar testine gönderdi. Adaptyv Bio ve Twist Bioscience iş birliğiyle 211 tasarım sentezlenip bağlanma yetenekleri ölçüldü; sonuçta 17 tasarım, belirlenen kriterleri (KD ≤ 1 µM ve yan etki olmaması) karşılayarak tek bir toksine bağlanabildi.

Proje, beş farklı skorpion toksinine (Cn2, Ts1, AaH I, AaH II, LqhIII) odaklandı ve hem tek toksin hem de çoklu toksin bağlayıcıları tasarlamayı denedi. Çoklu toksin bağlayıcıları henüz istenen bağlanma performansını gösteremedi; bu durum, mevcut tasarım araçlarının sınırlamaları, prompt stratejileri ve biyolojik fizyolojinin karmaşıklığı gibi faktörlere bağlanıyor. Tek toksin bağlayıcıları arasında en güçlü iki aday, Cn2-B1 ve Cn2-B2, tek haneli nanomolar KD değerleriyle Cn2 toksinine yüksek afinite gösterdi ve bilinen nötralleştirici antikor LR ile aynı epitopiye bağlandıkları kanıtlandı.

Bağlayıcıların laboratuvar testleri, iki farklı platformda (hücre dışı sistem ve insan böbrek hücrelerinde Fc füzyonları) gerçekleştirildi ve yüzey plazmon rezonansı (SPR) yöntemiyle KD ölçümleri alındı. Bağlayıcıların toksinleri nötralize edip edemeyeceği, hücre içi ve hayvan modellerinde henüz test edilmedi; bu aşama, güvenlik, stabilite ve maliyet gibi klinik geliştirme kriterlerinin değerlendirilmesi için kritik bir adım olacak. Anthropic, tüm 211 tasarım ve deneysel veriyi açık veri seti olarak yayınlayarak, araştırma topluluğunun antivenom geliştirme çalışmalarını hızlandırmayı hedefliyor.